Quando o SG-1 descobre o que acredita ser as ruínas da Cidade Perdida dos Anciãos – os criadores dos Stargates – O Comando Stargate inicia uma investigação. Uma nova equipa de exploradores chefiada pela civil Dra. Elizabeth Weir, viaja até à distante galáxia Pegasus, onde descobrem uma cidade evoluída mas abandonada no oceano, um grupo de humanos nómadas… e um inimigo mortífero que se alimenta de medo humano!